大腸桿菌K88誘導(dǎo)的仔豬腸上皮細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)變化的研究

       大腸桿菌是導(dǎo)致仔豬腸道功能紊亂及腹瀉的重要致病菌,其中ETEC K88是比較常見的致病菌之一,給養(yǎng)豬生產(chǎn)帶來重大損失。因此,為了揭示ETEC K88影響仔豬腸上皮細胞免疫功能的具體作用機制,喆圖小編有必要給大家分享一下ETEC K88攻毒(或不攻毒)的IPEC-J2細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)的變化。

       ETEC K88血清型為O149:K91:K88ac。試驗共分為2個處理組(對照組、K88組),每個處理組3個重復(fù)。將腸上皮細胞IPEC-J2接種于Transwell 6孔板上室,加入DMEM/F12*培養(yǎng)基,待細胞分化后(約為1.3×10~6個/孔),用ETEC K88攻毒處理細胞(K88:細胞=50:1),于37℃、5%氣套式二氧化碳培養(yǎng)箱中培養(yǎng)3 h。

       對差異表達基因(differentially expressed genes,DEGs)的GO(gene ontology)分析顯示,共553個DEGs注釋到21個GO條目,這些條目主要參與細胞過程、生物過程、代謝調(diào)節(jié)、信號調(diào)節(jié)、發(fā)育過程及免疫過程等。

       氣套式二氧化碳培養(yǎng)箱培養(yǎng)結(jié)束后,PBS清洗細胞2遍后收集細胞。采用RNA-Seq技術(shù)研究2組細胞的轉(zhuǎn)錄組,并對差異表達基因進行統(tǒng)計分析。結(jié)果顯示:與對照組相比,ETEC K88攻毒后,得到差異表達基因共126個,其中上調(diào)基因為80個,下調(diào)基因為46個。

       通過對差異表達基因的Pathway分析表明,差異表達的基因顯著富集于22個代謝通路。表明ETEC K88攻毒后顯著影響了IPEC-J2細胞的Toll-like受體信號通路、腫瘤壞死因子(TNF)信號通路、NF-κB信號通路、T細胞信號通路、MAPK信號通路以及趨化因子等信號通路。

       這些差異表達的基因大多富集于免疫反應(yīng)及炎癥反應(yīng)的相關(guān)通路中,表明差異表達基因在細胞中發(fā)揮了類似的功能。綜上,ETEC K88攻毒后,細胞發(fā)生相應(yīng)的免疫反應(yīng)及炎癥反應(yīng),這可能是ETECK88導(dǎo)致仔豬腹瀉的重要原因之一。

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